• Отец Нафанаил говорил: «Какое назначение человека в жизни? Когда богатый молодой человек имеет доброе сердце, он хочет сделать участниками своей жизненной радости и других людей. Потому-то он женится, обзаводится детьми, а также многочисленными друзьями. Господь тоже хочет сделать нас участниками Его блаженства, для того-то и населяет этот мир людьми».
• Говорил также: «Когда человек обращается к Богу с молитвой, то ему покровительствуют все, и даже бессловесные твари. Вот история. За одним человеком гнались и должны были убить. И вот, забежав в какие-то развалины, он увидел отверстие, где можно спрятаться, и залез туда. И тут же паук натянул на этом отверстии паутину. Подбежали те, кто его ловили. Осмотрели отверстие и решили, что здесь его быть не может, – натянута паутина. Так и паутинка может спасти от смерти, если будет на то воля Божия…»
• Отец Нафанаил замечал: «Как грешный человек изучает математику, ее четыре основных действия? Себе прибавлять, а у других отнимать. Свое умножать, а чужое делить. Другого извлекать с корнем, а себя возводить в степень… Получается, что для некоторых даже и математику изучать не полезно».
• Старец предостерегал: «Никогда не надо за толпой повторять те слова, которые она говорит. Потому что это может завести в погибель. Евангельская толпа сначала кричала: “Осанна, Сыне Давидов!” (см.: Мф. 21, 9) – когда Господь входил в Иерусалим. Но уже через четыре дня она закричала другое: “Возьми, возьми, распни Его!” (Ин. 19, 15) Неужели и мы будем это кричать? Страшное дело – примкнуть к толпе. Поэтому там, где неправда, “ура” не кричи, в ладоши не хлопай. Спросят: почему? “У вас неправда”. – “Откуда узнал?” – “Совесть подсказывает”».
• Еще говорил: «Церковь обладает всей полнотой бытия. В Церкви есть и литература – это Святое Писание, труды святых отцов и жития святых. В Церкви есть и музыка – богослужебные песнопения. В Церкви есть и труд, и отдых. В Церкви есть даже физкультура – установленные уставом великие и малые поклоны. В Церкви – полнота бытия, и все, что необходимо для спасения человека…»
• Отец Нафанаил объяснял духовным чадам: «Если угодно Господу и не пагубно для человека, то дается и внешнее счастье. Но внутреннее блаженство неотъемлемо от чистой и богоугодной жизни, которая при всех внешних лишениях и недостатках всякому приносит мир и радость, истекающие из спокойной совести…»
• Старец советовал: «Выброси из души самоцен, и не будет обидчивости. Памятуй, что рабе Божией должно быть тихой, скромной, приветливой…»
• Наставлял: «Молиться нужно: “Рассеянный мой ум собери, Господи!”»
• Еще говорил: «Добрые дела трудом приобретаются и болезнью исправляются. Не будет подвигов – не будет венцов».
• Отец Нафанаил советовал: «От послушания не отказывайся. В терпении спасай свою душу. Облегчения ты можешь попросить, но если облегчения не благословляют, то нужно понуждать себя к исполнению, ибо Царство Небесное нудится, силою берется (см.: Мф. 11, 12)».
• Как-то паломники, видевшие многочисленные труды и заботы старца, спросили отца Нафанаила, не желает ли он перейти на другое место. Он ответил: «Если дерево постоянно пересаживать, ничего путного из него не получится». И вспоминал слова наместника монастыря архимандрита Алипия (Воронова): «Как можно дольше удерживайтесь на одном месте».